吴晓求教授代表性著作主要有《资本市场解释》(2002)、《处在十字路口的中国资本市场》(2002)、《证券投资学》(2004)、《中国资本市场:股权分裂与流动性变革》(2004)、《市场主导型金融体系:中国的战略选择》(2005)、《中国资本市场分析要义》(2006)、《股权分置改革后的中国资本市场》(2006)、《梦想之路——吴晓求资本市场研究文集》(2007)、《中国资本市场:从制度变革到战略转型》(2007)、《中国资本市场:全球视野与跨越式发展》(2008)、《金融危机启示录》(2009)、《全球金融变革中的中国金融与资本市场》(2010)《变革与崛起——探寻中国金融崛起之路》(2011)《中国创业板市场:成长与风险》(2011)、《中国证券公司:现状与未来》(2012)、《中国资本市场:2011-2020》(2012)、《中国资本市场:制度变革与政策调整》(2013)、《中国资本市场制度变革研究》(2013)、《互联网金融:理论与现实》(2014)、《中国资本市场:开放与国际化》(2015)、《股市危机:历史与逻辑》(2017)等。